Evropska komisija načrtuje drugi razpis Sklada za inovacije za velike projekte 26. oktobra, drugi razpis za male projekte pa marca 2022. Proračun za razpis za velike projekte bo med 1,3 in 1,5 milijarde evrov, proračun za male projekte pa 100 milijonov evrov. Več informacij o stanju postopkov prvih razpisov in o pripravah na druga razpisa je na voljo prek posnetkov sej Strokovne skupine Sklada za inovacije. Člani lahko več informacij dobijo tudi na SBRA.
Evropska komisija napoveduje, da bo na podlagi mnenj in pripomb, ki jih je dobila po objavi prvega razpisa, postopke za drugi razpis za velike projekte poenostavila. Postopek bo enofazni, metodologija za ocenjevanje prijavljenih projektov bo v veliki meri ostala enaka kot pri prvem razpisu, navodila za prijavitelje pa naj bi bila bolj enostavna in razumljiva. Evropska komisija upa, da se bodo poleg novih prijaviteljev na drugi razpis prijavili tudi neuspešni prijavitelji iz prvega razpisa. Pri razpisu za male projekte niso predvidene bistvene spremembe.
| Razpis | Objava razpisa | Zaprtje razpisa | Objava rezultatov |
| Drugi razpis za velike projekte | 26. oktober 2021 | 1. marec 2022 | julij 2022 |
| Drugi razpis za male projekte | marec 2022 | avgust 2022 | prvo četrtletje 2023 |